mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATTTTGGGACGGAGGGAGT CCATCTTTTCTTTAAATGACA TCATTAGTTAACTTCCAATCTTGTAATGGTTATACCCATCTTTTCTTTAAATGACACTTATTAGACAGTCTGGGTTAATATTTCAACAATTCTTATCGTTAACACGGGATTGAAGCAGACTATTCATCTTCTTTGCATCACCATGATATCTTGTTTGCAAGCAAAGCATAGATAAGGAGTTATCAAAGAAGCTTCATTGGATTTGCTGCCTATCTCTCAAAGAGGAAAAACAAAAGTTGGCTGGGAAGTTTCAGTGACCAAAGACTATTATTTTGGGACGGAGGGAGTATTATAATGAAGACGTTTGGAGTTTTGGTTAT GTTTTCCATTTCTTTGTTGAAAATTCCCCACCTTCAACTTTTTTCCATTTCTAATTCAATCTTAGAGAGAATTCACACAACAACTAACATTTTACATAGATTACGAGAGTCTATATAGAGGGTATACAACGGAGTTTAAACCATCACGATGGTTTTGTGTAACCGTTGCAAGTTGCTACCCTTGAAGCCACAATATCATTAGTTAACTTCCAATCTTGTAATGGTTATACCCATCTTTTCTTTAAATGACACTTATTAGACAGTCTGGGTTAATATTTCAACAATTCTTATCGTTAACACGGGATTGAAGCAGACTATTCATCTTCTTTGCATCACCATGATATCTTGTTTGCAAGCAAAGCATAGATAAGGAGTTATCAAAGAAGCTTCATTGGATTTGCTGCCTATCTCTCAAAGAGGAAAAACAAAAGTTGGCTGGGAAGTTTCAGTGACCAAAGACTATTATTTTGGGACGGAGGGAGTATTATAATGAAGACGTTTGGAGTTTTGGTTATCTTAGTGATCATGGTCACCCTGATAGTGGGTAGAGTACATTCACAATCAAGGAATTGTGACATTGTTGACGTTGAGGATTGTGGTACGTCAATTACATACACTAACATCCTACCAACTGCAAAGTGTTGTGATGAACTCAGACAACATAGAAGTTGTCTTTGTTATTACACAAGTCAATACTTCAGCGCGAGTGCCGTTATCAGTAATTGTCATATCGATTTCAGCGAAGTTTGTCCGTCCTTATCTAAATAGCTAATGCACTAAGCCGTAAAAGCCATATATATGAAGGATATATAATTGCCTTTTTTCTTTAAGACAATATATGTATGTTATGGTTCATGTTTTCTTGTGAATAATATTAGTTTGATA 3 2 3' arm Taraxacum_officinale mirnest MIR1122 0.000005 osa-MIR1862e 0.00002 -61.4 ........((((((((((...(((.((.((.((((((.(((.((((..((((((..((....))..(((((.(((((..(((((..(((((((............))))))).(((((((((.....((((((((.......(((((.((((((((((.......)))..))))))).)))))))))))))......))).))))))(((..(((((...)))))...(((....))))))...))))).....)))))..))))).)))))).)))).))).)).)))).)).))....))).))))).....))))). (-61.4)