mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTCATTCCTATGTGA ATGTAGGGCTAAAAGCCATGGG GCTCTGCTGTGGCCTATGGCTTTTCATTCCTATGTGATTGCTGTTCTAAACTCATGTAGGGCTAAAAGCCATGGGCTACAGTGAGGGGC 2 1 5' arm Equus_caballus mirbase mir-135 2e-36 rno-mir-135b 1e-40 -46.74 ((((((((((((((((((((((((...((((((((((..............))))))))))..)))))))))))))))))))..))))) (-46.74)