mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTACAGTGCACGTGTCTCCAG GGAGACGCGGCCCTGTTGGAGT TACTCTACAGTGCACGTGTCTCCAGTGTGGCTCCGAGGCTGGAGACGCGGCCCTGTTGGAGTA 1 2 5' arm Equus_caballus mirbase mir-139 2e-26 eca-mir-139 4e-30 -37.4 ((((((((((.((.((((((((((((.((....))..)))))))))))))).))).))))))) (-37.40)