mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATTTTGGGACGGAGGGAGT ATCAATCGTCACAACATGAGA ATGGACTATCATTTTGGGACGGAGGGAGTATGAAATTTGTTTCCATTGTTGCAGGAGGTTATATCTGAAACCCACATAGTCCTCAACACCCTTTTTAGGTTTCCATGAATCAATCGTCACAACATGAGAGAGAA CATTTTGGGACAAACCAAAAAGGAAAGATGGACTATCATTTTGGGACGGAGGGAGTATGAAATTTGTTTCCATTGTTGCAGGAGGTTATATCTGAAACCCACATAGTCCTCAACACCCTTTTTAGGTTTCCATGAATCAATCGTCACAACATGAGAGAGAAACAGAAACAGAAACAAGGGATGACGGGAGTAGTTATGTCACTAACTTTGTCTACTAGTGGTTTATGTAAGACATTTGTGTAATGGTATTTTATAAAACATTTGTGTAATGGTCTTTTGTTTGACATTTGTGTATTGGTTTTTTATAAGACATTTATGTAATGGTCTTTTGTAAGATATTTGTGTAATGGTTTTTTG 5 1 5' arm Taraxacum_officinale mirnest MIR1122 0.00003 tae-MIR1122 0.0001 -28.6 .....((.((((.(((.(((((...((.(((((((((((.......(((((.((((((((........)))).......))))))))).......))))))).))))..))..))))).))).)))).)).... (-28.6)