mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACATTCAACGCTGTCGGTGAGT CATCGACCGTTGATTGTGCC TGAGTCTGAGGGTTGCTTCAGTGAACATTCAACGCTGTCGGTGAGTTTGGAATTAAAATCAAAACCATCGACCGTTGATTGTGCCCTGTGGCTAGCCATCCTCTCCTCCA 2 3 5' arm Equus_caballus mirbase mir-181 8e-27 lla-mir-181a-1 5e-40 -39.6 .(((...((((((.(((.(((.(.(((.((((((..(((((((.((((.((.......)).))))))))))))))))).))).).))).....))).))))))..))).. (-39.60)