mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATACTGCCGGGTAATGATGGA CGTCTTACCCAGCAGTGTTTGG CCGTCTTACCCAGCAGTGTTTGGGTGCTGGTTGGGAGTCTCTAATACTGCCGGGTAATGATGGA 3 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-8 3e-25 cfa-mir-200c 4e-30 -31.2 (((((((((((.((((((((.(((.(((.......)))))).)))))))).)))))).))))). (-31.20)