mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGT AGAAATGCAAACAGAGAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTGTCCATTACTTTGCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGCCTCTCTCTTTC GGTGCAAAGAAGAAGAAAGCAATACTCAGCAGGGATCTCTAGCTAGAATCTGAAAGACGAGTGAATTGAGGAGGGTTCTCGAGTATTCATTAGGGTTTGGAGGGATCTGTGAGGAATTAGATAGGAGAGTAAGAAAGTTATGTTCCTGAACAGGTTTTTATTTCTGGCTTTCAATAAATAGCTGATGTTAGAAGACAGAGAAGGAGGTGATTGAAGAAATGCAAACAGAGAAAACTGACAGAAGAGAGTGAGCACATGCAGGCACTGTTATGTGTCCATTACTTTGCGTGTGCGTGCTCACCTCTCTTTCTGTCAGTTGCCTGCCTCTCTCTTTCACTCTCTCTATCTTCTTTCACTCTCAAATTTATTTACCTTCTTATCATCTATACATATCACTATATCACTGACCTTCTTATCATCTCTTTTGTTGTGCACTTGGCTCTCGTGATGTGGATAAGACTGTTACCCTTTCACATTCGTTTCGTTACTTGTATATATTACTAATATGTTTAATTTTTTTTCTGTATTGTGTTGAAGTGGGTGCTTAAGAATGTTTGATCTCGAGCAGTTTGGGTGGACAAAAGCTACGATTTTTTTATTTGGGTTTATGATTTTAAGTATATAATTTTAACTG 1 2 5' arm Thellungiella_halophila mirnest mir-156 4e-35 ath-MIR156b 2e-46 -45.7 ........(((.(((((.(((((((((((((((((((((((.((((.(((..((.(((....))).))..))).)))).))))))).))))).))))))))))).......))))).))). (-45.7)