mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAGACGAGCAAAAAGCTTGT GAGCTTTTGGCCCGGGTTATAC TTCCTGTGACGGGCGAGCTTTTGGCCCGGGTTATACCTGATGCTCACGTATAAGACGAGCAAAAAGCTTGTTGGTCAGAGGAG 4 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-208 1e-31 hsa-mir-208a 9e-35 -41.7 .((((.((((.(((((((((((.((.((..((((((.((.....)).))))))..)).)).))))))))))).)))).)))). (-41.70)