mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAGACGAACAAAAGGTTTGT AAGCTTTTTGCTCGCGTTATGT CCTCTCAGGGAAGCTTTTTGCTCGCGTTATGTTTCTCATCCGAATATAAGACGAACAAAAGGTTTGTCTGAGGGCAG 4 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-208 5e-30 bta-mir-208b 2e-38 -31 .((((((((.((((((((((.(((..((((((((.......))))))))..))).)))))))))).))))))))... (-31.00)