mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTACATCTGGCTACTGGGT TCAGTAGCCAGTGTAGATCC GCTGCTGGAAAGTGTAGGTACCCTCAATGGCTCAGTAGCCAGTGTAGATCCTGTCTTTTGTAATCAGCAGCTACATCTGGCTACTGGGTCTCTGATGGCATCTTCTAGCT 2 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-221 3e-26 hsa-mir-222 4e-53 -49 ...((((((......((((.((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).)).)))))))))). (-49.00)