mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGTGGGATGGTAAACCGCTT ATGGTTTACCGTCCCACATACA AAGAAATGGTTTACCGTCCCACATACATTTTGAGTATGTATGTGGGATGGTAAACCGCTTCTT 1 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-299 4e-24 cfa-mir-299 9e-28 -40.5 (((((.((((((((((((((((((((((.......)))))))))))))))))))))).))))) (-40.50)