mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGCAATGATATTGTCAAAGC TGTGACGATGTTGCACTACT CCTCCTGCTGGCCGCAGGTGCTGTGACGATGTTGCACTACTGTGCTCTGAGAAGCAGTGCAATGATATTGTCAAAGCATCTGGGACTAGCCTTGGGG 2 3 3' arm Equus_caballus mirbase 100 eca-mir-301b 3e-50 -45.7 .((((.(((((((.((((((((.(((((((((((((((.((...(.....).)).))))))...))))))))).)))))))))).)))))...)))) (-45.70)