mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGTGCTTCCATGTTTTAGTGA ACTTAAACGTGGATGTACTTGCT CCACCACTTAAACGTGGATGTACTTGCTTTGAAACTATAAAAGTAAGTGCTTCCATGTTTTAGTGATG 3 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-302 2e-29 cfa-mir-302a 2e-28 -30.6 ....((((.(((((((((.(((((((((((.........))))))))))).))))))))).))))... (-30.60)