mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCACTGCCCCAGGTGCTGCTGG CGCATCCCCTAGGGCATTGGTG CTGACTATGCCTCCCCGCATCCCCTAGGGCATTGGTGTAAAGCTGGAGACCCACTGCCCCAGGTGCTGCTGGGGGTTGTAGTC 5 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-324 6e-36 eca-mir-324 6e-42 -38.6 ..((((((..(((((.(((.(.(((.(((((.(((.((..........))))).))))).))).).))).)))))..)))))) (-38.60)