mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACACACCTAGTTAACCTCTTT AGAGGTTTTCTGGGTTTCTGTTTC GTGTTAATCAGTGGTACCTGAAGAGAGGTTTTCTGGGTTTCTGTTTCTTTAATGAAGATGAAACACACCTAGTTAACCTCTTTTCCAGTATCAGATCC 3 2 3' arm Equus_caballus mirbase mir-154 3e-29 oar-mir-329b 4e-37 -36.1 ...........((((((..(((((((((((..((((((...((((((............)))))).))))))..)))))))))))..))))))..... (-36.10)