mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTCCTATGAGATGCCTTTCCTC GAACGGCTTCATACAGGAGCT GTAGTCAGTAGGTGGGGGGTGAGAACGGCTTCATACAGGAGCTGATGCGCAGTTACCCAGCTCCTATGAGATGCCTTTCCTCACCCCTTCAC 4 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-337 3e-26 eca-mir-337 3e-47 -39.62 ...........((((((((((((((.(((.((.((.((((((((.............)))))))).)).)).))).)).)))))))).)))) (-39.62)