mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGACTCCTAGTCCAGTGCTC GCCCTGAACTAGGGGTCTGGAG ACCCAACCCCAGGTCTGCTGACTCCTAGTCCAGTGCTCGTGATGGCTAGTGGGCCCTGAACTAGGGGTCTGGAGGCCTGGGTTTGAATATCGCCAG 4 0 5' arm Equus_caballus mirbase mir-345 5e-34 eca-mir-345 1e-49 -48.2 ...(((.(((((((((.(.((((((((((.(((.(((((..........))))).))).)))))))))).).))))))))).)))........... (-48.20)