mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTCCTAGAAATTGTTCACA TAAACAATTCCTAGGCAATGT TGTTAAATCAGGAGTTGTAAACAATTCCTAGGCAATGTGTATAATGTTTGTAAGTCATTCCTAGAAATTGTTCACAATGCCTGTAACA 2 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-384 2e-36 mmu-mir-384 4e-40 -29.4 .((((...((((.(((((.(((((((.(((((.((((..((((.....))))...))))))))).))))))).))))).)))))))). (-29.40)