mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCAGCAATTCATGTTTTGAA CAAAACGTGAGGCGCTGCTATA CGAGGGGATGCAGCAGCAATTCATGTTTTGAAGTGATTTAAACGGTTCAAAACGTGAGGCGCTGCTATACCCCCTCGCGGGGAAGTTGGAAGGTGGGG 3 0 5' arm Equus_caballus mirbase mir-322 2e-27 bta-mir-424 2e-36 -42.6 (((((((.((.((((((..(((((((((((((.((.......)).)))))))))))))..)))))).)).)))))))..................... (-42.60)