mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCATGATGGGCTCCTCGGTGT TACGGTGAGCCTGTCATTATTC TGCCCGGGGAGAAGTACGGTGAGCCTGTCATTATTCAGAGAGGCTAGATCCTCTGTGTTAAGAAGGATCATGATGGGCTCCTCGGTGTTCTCCAGGTAGCGGCACCACACCATGAAGGCAGCCC 5 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-433 4e-44 mmu-mir-433 8e-64 -45.7 ((((...((((((...(((.(((((((((((.(((((.(((((......))))).))........))).))))))))))).)))...)))))).(((.(.(....).)))).....)))).... (-45.70)