mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGTGCAATATTGCTTATAGGGT CCTATCGATATTGTCTCTGCT AGAACCCTATCGATATTGTCTCTGCTGTGTAAATCGCTCTGAGTAGTGCAATATTGCTTATAGGGTTTT 1 4 3' arm Equus_caballus mirbase mir-454 1e-27 cfa-mir-454 3e-31 -24.9 (((((((((((((((((((..((((((((.....)))....))))).)))))))))...)))))))))) (-24.90)