mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTATTACATGGCCAATCTC GGTTGTCCATGGTGTGTTCATT ACCCTAGCCAGGTACTCGAATGGAGGTTGTCCATGGTGTGTTCATTTTATTTATGATGAGTATTACATGGCCAATCTCCTTTCAGTACTAAATTCTTCTTGGG 3 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-154 5e-31 cfa-mir-496 1e-46 -37.6 .(((.((...((((((.(((.((((((((.(((((..(((((((((........)))))))))..))))).)))))))).))))))))).....))....))) (-37.60)