mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGTCAACACTTGCTGGTTTCCT GGAGCCAGGAAGTATTGATGTT GATGCACCCAGTGGGGGAGCCAGGAAGTATTGATGTTTCTGCCAGTTTAGCGTCAACACTTGCTGGTTTCCTCTCTGGAGCATC 2 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-505 2e-36 mml-mir-505 2e-42 -44.9 (((((..((((.(((((((((((.((((.((((((((...........)))))))).)))).))))))))))).)))).))))) (-44.90)