mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCTCCCACACCCAAGGCTTGCA CATGCCTTGAGTGTAGGACCGT GATTTGCTTTCTCTCTTACATGCCTTGAGTGTAGGACCGTTGGCATCTTAATTACCCTCCCACACCCAAGGCTTGCAGGAGGGCAAGCCT 6 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-188 5e-40 eca-mir-532 4e-46 -33.72 .....((((.(((((((.((.((((((.((((.(((..((.............))..))).)))).)))))).)).))))))).)))).. (-33.72)