mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAATACATGGTTAACCTCTTT AGAGGTTATCCGTGTTATGTTC AACTGTTCAAGGATATTTGAGGAGAGGTTATCCGTGTTATGTTCGCTTCATTCATCATGAATAATACATGGTTAACCTCTTTTTGAATATCAGACTC 3 0 3' arm Equus_caballus mirbase mir-154 2e-27 ppy-mir-655 8e-48 -35.2 ....(((....((((((..(((((((((((.((((((..((((((............))))))..)))))).)))))))))))..)))))).))).. (-35.20)