mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCATTCGGCTGTCCAGATGTA CATCTGGGCAACTGATTGAACT AAGATGAGGAGTTAAGAGTTCATTCGGCTGTCCAGATGTATCCAAGTACCCAGTTATTTGGCAATAAATACATCTGGGCAACTGATTGAACTTTTCGCTTTTCATGACTCA 2 0 5' arm Equus_caballus mirbase 100 bta-mir-1298 1e-43 -50.9 ...(((((((((.(((((((((.((((.((((((((((((((((((((......)))))))......))))))))))))).)))).))))))))).)))))))))...... (-50.90)