mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAAGGGAGGTGTGGAGTAG ACTCCGTACCTTTCTTTTATT TTACTCCTATACTTCATTTTTTATACTAAAATACTCCGTACCTTTCTTTTATTGGAAAGTAAGAGAGACAAAAAAAGTGCCTATTTCTCTTGGTTTTTTCAATCAAAGGGAGGTGTGGAGTAGAGGTGTCAGAAGTAAAGTATAAGAATAAT TGAAAATGTTGCTAATGAACCCTTTTTCCTCTTCTCTGATACAATTTTTAGATTTCTTTAGGAAAATGTTGCTAACAAAGATTTTATTTAGTTAAATATGAATTATCAATGGTGTTACTCCTATACTTCATTTTTTATACTAAAATACTCCGTACCTTTCTTTTATTGGAAAGTAAGAGAGACAAAAAAAGTGCCTATTTCTCTTGGTTTTTTCAATCAAAGGGAGGTGTGGAGTAGAGGTGTCAGAAGTAAAGTATAAGAATAATGTTTGAAGAAAGACAAGTGGATGCATGCAGCTATTATTAGAGCCTCCTAAAATTCGGAGACGCCCCTGATTTTATGGGTGATGAGAGAAGACTGATGAGAACCAAAAAAATTTTGATTTTATCATAATAGCACATTGACCAACACAAAATACCTTGATTAACAAGACAAATAAAAAACAAAAACAAAAGAGGAGGGAGGGTTTGTTTGTTTCTCTCAGTTTATTTCAAATCAAAGCAAAACTCCATGGAAGTAGACAGTGAAAACATCAAAGAGAAGGATCTATTCAAAGCAGCTGAAGAAGGAGATTCT 2 0 3' arm Trifolium_pratense mirnest 100 mtr-MIR2119 0.0000005 -50.6 (((.((.(((((((.((((((.(((((....((((((((((((((((((.((((((((((((((((((...............)))))))))..))))))))).))))))))))))))))))..))))).)))))).))))))).)).))). (-50.6)