mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAATGCCCCTAAAAATCCTTAT GAGGGACTTTTGGGGGCAGATGT CCGCAGGGAAAATGAGGGACTTTTGGGGGCAGATGTGTTTCCATTACACTATCATAATGCCCCTAAAAATCCTTATTGCTCTTGCAG 4 1 3' arm Monodelphis_domestica mirbase mir-365 5e-43 gga-mir-365-1 4e-43 -37.9 ..((((((..((((((((..((((((((((((((((((.......)))).)))....))))))))))).))))))))..)))))).. (-37.90)