mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTTCGTCCCAAAATAT ATTTAGGGACAGAGGGAGTAA TGCAGTATGGAACTCCCTTCGTCCCAAAATATAAATAAAAAGTGGTCAATCAAAGTGGATGTATTTAGGGACAGAGGGAGTAATGCAGCAT TTTTCATCGAAATTGAATACGTTACATCATCATATTGCAGTTGTAGAGGATTCAGATTCCTTTTCACCTACATAGTTTAACATGAGACCTAAATTCTCTACCGTTGTTGCAGTATGGAACTCCCTTCGTCCCAAAATATAAATAAAAAGTGGTCAATCAAAGTGGATGTATTTAGGGACAGAGGGAGTAATGCAGCATCCGTAGAGATCCGATTTCTTTAACTTGAAGAAAGCCAAACCAAGAAAATTTAAATAGGAGTGAAGTAAACCACATTAGTAATTGTTCCACATGTGGGGCATACCCACATCAGATAAGTAACTTTCAGAACTTCCTTCTCCTAAGCTTGGTGATGACCCTTTTAGAATTTGATTATTAATAGGGTTTCTTTCCATTTTTGAGAGTTGACTCAAAACAGCTTTTAAAACTTTTCTATCACATGATAAAGGGTCTAAACTATAAGGTGCTTCTCCAAATGTAGTTGCATTGTTATTGTTGGATATAGGTAATTTTGGTTCCATATTATTGGTTGTTATATGGTTGAAGATAGGGTTTGTTTGGTTTTGAGAAAAAATGGAGAAGCAGGGCACTTGCTCAAATTCATCTGTATGGAATTGAGCTTGATCAAAACTTATGTAAGAATCCATTAATGCTGGAAGTGATGAAGATCCTGTGTCATCATAGCAACTACCCATGCTTGGTTTTGTAGCAACTTCTCTGTTTTTGTAGAACACCCTACACAAAACCCAATCTTCCTTAGAAGAAGAAATTTTAGGAGGGCCATGAGGACCCTCAATGCGAAATTCATGCATAACCCATTCAGTTTTTCTTCCTTTAGGTGCCCTTCCTTGATAGAACACTAAAG 2 0 5' arm Trifolium_pratense mirnest MIR1122 0.00002 100 -31.9 (((.((((...((((((((.(((((.(((((((..((.....(((....)))...))..))))))).))))).)))))))).)))).))). (-31.9)