mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGT TGGTTTCATATGGTGGTTTAGA CTTCAGGAAGCTGGTTTCATATGGTGGTTTAGATTTAAATAGTGATTGTCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCTTGGGGG 1 2 3' arm Lagothrix_lagotricha mirbase mir-29 2e-26 eca-mir-29b 9e-41 -34.02 (((((((((((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).)))))))))).))))))))). (-34.02)