mature_miRNA	miRNA*	pre-miRNA	EST_contig	mismatches	bulges	arm	species	source_database	RFAM_best_hit	RFAM_lowest_evalue	miRBase_best_hit	miRBase_lowest_evalue	folding_energy	secondary_structure
TCATCATCATCATCATCTTCA GAGATGAGACTGGAGTGGTG AGCTGGAGTTGCAATGGGGGCTGGTGTTGTTGGTTTGGAAGGAGTGGCTACCGGAGATGAGACTGGAGTGGTGGTGGCCGGAGTTGATGGTGAGGTTGTTGGTGCGGCTGAAGGGGACTGACCTCCGACGCCGGCGCCTCGTGCCGAATTCCTGCAGCCCGGGGGATCCACTAGTTCTAGAGCGACCGCCACCGCGGTGGAGCTCCAGCTTTTGTTCCCTTTAGTTTGGGTACCGAGCCCCCCCTCGAGGTCGACGGTATCGATAAGCTTGATATCGGTTATCGTCATCCCAGTTCCTACTGGTCATCATCCTCCTCATCACTGCCCTCCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCTTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATTCATCATCATCAT CCTACTGAGCGATCTGAGGATCTACTAGTCATATGGATTGAGGTCGACGGTATCGATAAGCTTGATATCGAGCAGATTCACTTGGTCCTGGTGAAGACGCAGCAGATTCACTTGGTCCTGGTGCTCCTGTTGGTGGTGCAGGTGGACCCTCCAATGTTGGTGATGGTGATGGTGCTGGAGCACTGTGTTTCTTTCCCTTCTTTGGTGCCGGAGCTGGAGCCTCCGGTGTGGTGGTAGGAGGCGCCACCACAGGTGCCACTGCCGGAGGTGAGCTGACTGGAGCAGGAGTGGGTGGTGATTTTACTGGAACAGGTGTTGGTGGTGGAGTGCTGACAGGTGTCACCGCCGCCGGTGGTGGTGTGGTCACCGGAGCTGGTGTGGTGGTTTTGGAAGGAGATGCGGCTGGTGTTACGGCGGGTTTGGGGGATGCAGCTGGAGTTGCAATGGGGGCTGGTGTTGTTGGTTTGGAAGGAGTGGCTACCGGAGATGAGACTGGAGTGGTGGTGGCCGGAGTTGATGGTGAGGTTGTTGGTGCGGCTGAAGGGGACTGACCTCCGACGCCGGCGCCTCGTGCCGAATTCCTGCAGCCCGGGGGATCCACTAGTTCTAGAGCGACCGCCACCGCGGTGGAGCTCCAGCTTTTGTTCCCTTTAGTTTGGGTACCGAGCCCCCCCTCGAGGTCGACGGTATCGATAAGCTTGATATCGGTTATCGTCATCCCAGTTCCTACTGGTCATCATCCTCCTCATCACTGCCCTCCTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCTTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATTCATCATCATCATCATCATCATCATCATTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATTCTCATCATCATCATCATTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCTTCAATCATTCATATCATCCTCCATCATCATCATCATTCATCATCATCTTCATCATCATCGTTCATCATCATTCTTCATCATTCATCTTTCATCATCATCATTCTTATCAACTTTAATGATCAATTATAAAACGGATCCCCGCGGTACACGAGCCTTAAATTTCCTGGCCCGCTCTTTTTAACACGTTGGTACGGGAGAAAACCGGGGGGCTTACACAATTTATCCCC 5 1 3' arm Trifolium_pratense mirnest  100  100 -118.9 .....((..((.(((((.((.(((((.((.((((.(((...((((((.....((((((((...(((.((((((((((...((..(((((((((((.....((.((((.(((.(((((.(((((...(((((((((((...)))))).......)).((((((((((..((..((((...((((..(((((.....))))).)))).))))..)).)))))......)))))..((((......)))).((..(((((((((((((.......)))))).)))))))..))..)))......)))))...))))).)))...)))))).)))))))))))...))....))))))))))..)))...))))))))....))))..)).)))..)))).)).))))))).)))))))...))..... (-118.9)