mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAGTTTCTCTTCTTGATTCT AAATAAGAAGTTGGACGATGA CTGACGAACACATAGTTTCTCTTCTTGATTCTCTCTGCAAAATCAAGAAAGCTTACGAGGAGAAGCTATTGAAGAAATCTAATTCCGTTTTGATCAATGAGATTCAAGTTCGAGAACAGGTTCTTGAGAAATTGAAGTCTCTTGCTAAAAATAAGGATAACGAGATCGCTCGTTTGAGACGAGCCTATAATGATTTGGAAACGGGAAATAAGAAGTTGGACGATGAGGTTCGAG AGCCCACAATCAAAATCCTTGTAAACCCATTTGCCTTCTTTGAGTTCTTTAATCAGACCTTGGCTAATTAATGAGTTTCAAGCCGATTAAACCCCTTTCAAATATGCCAGCTATGGATACAAAGCCTACCAAAATCATTAAACCCAGGTCAATAGGTGTCTTTAATACATTCGGAATCCTAGACGATGATCAAACTTATCGGATAATTTCCGGTTACAACCCACCTTCAGTAAAGGACGAGCCAGAAGTTCGACAAAAGCTCGACTTGCCACAAAAAAAGGGGAATGTTGTTTTATGTAAGCATACGGAGATCTTGAATTTGCTCGATATGCTCTCGTCTCTGAAACTAGCGTATATTAAGCTCCAAGATGCCCACGTTTATTACAATCCCGATAAAATCCGAGCCGCTGACGAACACATAGTTTCTCTTCTTGATTCTCTCTGCAAAATCAAGAAAGCTTACGAGGAGAAGCTATTGAAGAAATCTAATTCCGTTTTGATCAATGAGATTCAAGTTCGAGAACAGGTTCTTGAGAAATTGAAGTCTCTTGCTAAAAATAAGGATAACGAGATCGCTCGTTTGAGACGAGCCTATAATGATTTGGAAACGGGAAATAAGAAGTTGGACGATGAGGTTCGAGAGAGTTTGCATTGCTCGTCATTCGAAAACGCTGTTAAAGAGGTCGGAAAAGCTATTCATGGCTTTGCTAAGCCATTGATTAGNCTATTGAAGGTCTCGGGTTGGGATCTCGATCGGGCGGCTAATGCGGTTCAAGAATC 4 0 5' arm Triphysaria_pusilla mirnest 100 100 -58.6 ....(((((.(((.((((..(((((((.(((((......((((((.((.(((((........))))).))......((((...(((.(((((..(((.(((((((((.((((((((....))))))))...))))).))))))).)))))....))).....)))).(((((((...)))))))......))))))......))))).)))))))..)))).)))..))))).. (-58.6)