mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCTTTATATGCCCATA GCTTGGGAAACATACTTCTTTATATGCCCATATGGACCTGCTAAGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATCTCAGGC 2 1 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-1 8e-29 eca-mir-1-2 2e-35 -36.5 ((((((((.((((((((((((((((..((((((((.....)))...))))).)))))))))))))))).)))))))) (-36.50)