mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAAATCCCAGTCTGCCGAA CTGGATACAGAGTGAAGTGGCTGGCCCCGTCTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTGTCTTACTGCGCTCAACAACAAATCCCAGTCTGCCGAATGGTGCCAGCCATTGCA 2 2 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-7 4e-41 mne-mir-7-2 2e-55 -48 (((....)))..((.((((((((((.((((.(((.(((((.(.(((((.(((((((............))))))))))))).))))).))).)))).)))))))))).)) (-48.00)