mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAAATCACAGCCGGCCTCA AGATTAGAGTGGCTATGGTCTAGTGCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTCTGATGTGCTACGACAACAAATCACAGCCGGCCTCATAGCGCAGACTCCCTTCGAC 4 2 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-7 1e-41 hsa-mir-7-3 9e-51 -39.1 ......(((.((....(((((.((((((((.((..(.((.(((((((.((((((.((......)).))))))))))))))).)..)).))))))))))))))).)))... (-39.10)