mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTACCAAAATG TTTTGGGTCGGAGGGAGTATG CCAAATTTTGTACTCCCTCCGTACCAAAATGATTGCAATCATTTTGGGTCGGAGGGAGTATGTTTGATC CTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAGAATCAGCGTAACATTCATAGATTAGTATTTAGAGGGCCAAAACCATATAAATATCAATTACAAAACAGAGTGCAAAGTTTCAGCCATGGTTTAATTAGGATTATCTAATAAATATATTCCAAATTTTGTACTCCCTCCGTACCAAAATGATTGCAATCATTTTGGGTCGGAGGGAGTATGTTTGATCCATCGGTAAAACTCAAAATCACCAATCTTCACACATTCAATGACAATAATTATATGACAGGGGTAAACCGGTTCATGCTAAAATATACTATGTCTAAATTCTTCAGCAAAACTGATACGACGGTCCGATAATCAGACTTAGTTCTAGACTCCTCACACACCTGTTTATCCCCAATCTTCAAAAACCGATCCATATATTCTACGGAATCCTCGTGATATTTATCGGCCTGAACATTCCTCAACCCCTCAAAATCACCAGGACCATCGGTCAAATATTCAAAACCTTCAACTTTATCTTTTCCTATGTCAAATCTACGCAATTTCTTCACTGTTTTATATTCACGACAAATTGTACAAAGCGTCATACTCAGATCTATCTCACCCCAGTACCCGAATAAAATACTTAAAGCTCCCCTACAACATAATAAGCGTCTTTTAATATCACAAATC 2 0 5' arm Triphysaria_pusilla mirnest 100 tae-MIR1137 0.0002 -34.4 .(((((...((((((((((((..((((((((((....))))))))))..)))))))))))))))))... (-34.4)