mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGCTGTTGCATTGC AGTGCCTCGGCAGTGCAGCCC GCGGGCGGCCCCGCGGTGCATTGCTGTTGCATTGCACGTGTGTGAGGCGGGTGCAGTGCCTCGGCAGTGCAGCCCGGAGCCGGCCCCTGGCACCGC 2 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-33 1e-28 hsa-mir-33b 2e-48 -59.5 ((((.((((.(((.((((((((((((..(((((((((.(((.....))).)))))))))..)))))))))).))))).))))(((...))).)))) (-59.50)