mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATCACTAACCACACGGCCAGG AGGCAGTGTAGTTAGCTGATTGC AGTCTAGTTACCAGGCAGTGTAGTTAGCTGATTGCTGATAGTACCAATCACTAACCACACGGCCAGGTAAAAAGATT 3 1 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-34 8e-29 mml-mir-34c 2e-38 -30.9 (((((..(((((.(((.((((.(((((.((((((.((....)).))))))))))).)))).))).)))))..))))) (-30.90)