mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACTGCTTTATCTGTCAGA TACAACGAATTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAACGCACTTGCATGTTCGATGCACTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTTTATCTGTCAGATTCCTGCG GAAGTCTCTCAGATCTATCTCTACAGCCTCAAAGTCTCCTCCCTTCACGCTCAGAATTTGTATTGGTAAATTAAGTGAGTTCCGGAACAAAAGTTTAGAGAAGTACAACGAATTTGACAGAAGAGAGTGAGCACACAAACGCACTTGCATGTTCGATGCACTTGCTTCTCTTGCGTGCTCACTGCTTTATCTGTCAGATTCCTGCGCCGATTCTTTCGGGATGAAAAGAAGTTCACCTTGGGATTTGTTTCTGAGTGACGGGTTATTAATATTTTACAAATCATGTGAAGTACTATCTAATTATTGTCTCCCTTGTACCACTACGTGTCTCTTTGTCATGAAGTTCTTACTTTCGGTCTTGTTTTCCACTCTTTACAGACCACCCACGCAGATACGTTAAAAACTAGGTAGTACATGTACTCCTGTAATTGGCAAAATTGGCAACAATTGGGTTTTAACTTCGTCAAGAGAAAGATATTGCTTTTTTGGTGCGTGCGAAATGTGTTTT 1 2 5' arm Brassica_napus mirnest mir-156 0.000000000000006 ath-MIR156c 2e-33 -39 ......(((((((((((((((((((((((((.(((..(((..(((((.....)))))..))).....))).))))))))).)))).))))))))))))..... (-39)