mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGAATCCTGATGATGCTGCT CGGCTTTATCATATGCCCTG CAATTTTGTTGTGGTGTTGTTAATGATATCTGCGGAGGTTGTGGGAATCCTGATGATGCTGCTGCAGCATTGGCTAACAATCGACGGTCATGATTCATTTGTTGCCACTGTTGTTGTTCTCCATTTCTTGACACGTCATCTCCTCCTCCCGGAAATTGATGACTTTGATAATTATGTGAGTTAAATGGTAGCCTGTTAAACATTTGAAGCATGTGGGGTTCATTTGTTTGCTTGACTTGTCCAAACCTATGTTGCTGCTGCATTTCATCTCTTCTTTCAGGCTGCCGGAAATTCAACTCAGGTCTTAATCCTTGGCGTCTCCAATCACCACTAAATTGTGTTGAGAAAGAATTTCTTTGTTGTGAAGCTGAGTTTCCCAAACTTAGGTCCAAATTGTGGTCTGATGATGATGCATTGTTTGAAGACTCTGCGGCTTTTAGTTCATCATCATAAATGGATGGATCAAAATTGGTAACAGCTTCCTTGCCATTACATTTTATGGCGGCTTTATCATATGCCCTGGCAGCTTCAACTTCAGTATCAAACAAACCCAAATAAACA TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGCGAAAATTCCTTTTTATAGCAGAAGGTGGGGAAAAAAGGACATGAGAAGAAAACAAAAGAAATAAATAAATAGATATAAAATGCATGGATCATGAAGGTCTGATGAGATGGTGGATCCCATTACTGTGCACCCAATTTTGTTGTGGTGTTGTTAATGATATCTGCGGAGGTTGTGGGAATCCTGATGATGCTGCTGCAGCATTGGCTAACAATCGACGGTCATGATTCATTTGTTGCCACTGTTGTTGTTCTCCATTTCTTGACACGTCATCTCCTCCTCCCGGAAATTGATGACTTTGATAATTATGTGAGTTAAATGGTAGCCTGTTAAACATTTGAAGCATGTGGGGTTCATTTGTTTGCTTGACTTGTCCAAACCTATGTTGCTGCTGCATTTCATCTCTTCTTTCAGGCTGCCGGAAATTCAACTCAGGTCTTAATCCTTGGCGTCTCCAATCACCACTAAATTGTGTTGAGAAAGAATTTCTTTGTTGTGAAGCTGAGTTTCCCAAACTTAGGTCCAAATTGTGGTCTGATGATGATGCATTGTTTGAAGACTCTGCGGCTTTTAGTTCATCATCATAAATGGATGGATCAAAATTGGTAACAGCTTCCTTGCCATTACATTTTATGGCGGCTTTATCATATGCCCTGGCAGCTTCAACTTCAGTATCAAACAAACCCAAATAAACATACTTTTTGCCCAAGAATTGGCCCATCC 5 1 5' arm Triphysaria_pusilla mirnest 100 100 -137.1 ......((((.(((..(((((..(((((.(((..(((((((((((.....((((((.((((((((((((.((((.(((((..((..........))..))))))))).))))))((((...........)))).((((((...(((....)))....))))))....((((..(((((((((...((((((((((.........((((..(((((((((.(((..(((((...((....)))))))..)))..))).))))))))))..........))))))))))..))))).(((.((((.......((((((.((..((((((.(((......))).))).(((((...))))).))).)).))))))........)))).)))(((.....)))..(((((((((.(((..(((....)))..))).(((...))))))))))))..(((((..(((......(((....)))..)))...))))))))).)))))))))).))))))....)))..)))))))).....)))))))))))))..)))....)))) (-137.1)