mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACCCGTAGATCCGATCTTGTG CAAGCTCGCTTCTATGGGTCTG CCCATTGGCATAAACCCGTAGATCCGATCTTGTGGTGAAGTGGACCGCACAAGCTCGCTTCTATGGGTCTGTGTCAGTGTG 4 0 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-10 3e-25 lla-mir-99a 9e-41 -39.6 ..((((((((((.(((((((((..(((.((((((.((........)))))))).)))..))))))))).)))))))))).. (-39.60)