mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTTGCGGTCTGGGCTTGC CGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGCA CTGCCCTTCGTGAATCTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCTGTACATAACTCAATAGCCGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGCATTCGCGGAGGGCGC 3 3 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-129 3e-26 rno-mir-129-2 7e-45 -49 ..((((((((((((((((((((.(((..(((((((((((..........)))))...))))))..))).))))))).))))))))))))).. (-49.00)