mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGTCCCCTTCAACCAGCTA GCTGGTCAAACGGAACCAAGTC CCTCAGAAGAAAGATGCCCCCTGCTCTGGCTGGTCAAACGGAACCAAGTCCGTCTTCCTGAGAGGTTTGGTCCCCTTCAACCAGCTACAGCAGGGCTGGCAATTCCCAGTCCTTGGAGA 4 0 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-133 2e-43 hsa-mir-133b 7e-61 -49.3 .(((.((.((..(((((((((((((.((((((((..((.((.((((((.((.((((...)))))))))))).)).))..)))))))).)))))))..))))..))....)).)).))). (-49.30)