mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTTATTCCTATGTGA ATGTAGGGATGGAAGCCATGAA AGATAAATTCACTCTAGTGCTTTATGGCTTTTTATTCCTATGTGATAGTAATAAAGTCTCATGTAGGGATGGAAGCCATGAAATACATTGTGAAAAATCA 0 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-135 2e-42 eca-mir-135a-2 5e-52 -35.1 .(((...(((((....(((.((((((((((((.((((((((((((.(.(.....).).)))))))))))))))))))))))).)))...)))))..))). (-35.10)