mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGCTTTTCATTCCTATGTGA ATGTAGGGCTAAAAGCCATGGG CACTCTGCTGTGGCCTATGGCTTTTCATTCCTATGTGATTGCTGTCCCAAACTCATGTAGGGCTAAAAGCCATGGGCTACAGTGAGGGGCGAGCTCC 2 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-135 2e-36 hsa-mir-135b 3e-50 -47.2 ..(((((((((((((((((((((((...(((((((((((((......)))..))))))))))..))))))))))))))))))).))))......... (-47.20)