mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCATTTGTTTTGATGATGGA CATCATCGTCTCAAATGAGTCT TTGGATGAGCCCTCGGAGGACTCCATTTGTTTTGATGATGGATTCTTATGCTCCATCATCGTCTCAAATGAGTCTTCAGAGGGTTCTATCAT 3 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-136 1e-37 oar-mir-136 1e-43 -48.1 ...(((((((((((.((((((((.(((((...((((((((((.........))))))))))...))))))))))))).)))))))).))).. (-48.10)