mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGTGGTTTTACCCTATGGTAG ACCACAGGGTAGAACCACGGA TGTGTCTCTCTCTGTGTCCTGCCAGTGGTTTTACCCTATGGTAGGTTACGTCATGCTGTTCTACCACAGGGTAGAACCACGGACAGGATACCGGGGCACC 1 1 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-140 5e-40 mml-mir-140 5e-52 -55 .(((((((.....((((((((((.(((((((((((((.(((((((..(((......)))))))))).))))))))))))))).)))))))).))))))). (-55.00)