mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGAACTGAATTCCATGGGTT CCTGTGAAATTCAGTTCTTCAG CCTATGTGTATCCTCAGCTTTGAGAACTGAATTCCATGGGTTGTGTCAGTGTCAGACCTGTGAAATTCAGTTCTTCAGCTGGGATATCTCTGTCGTCGT 2 0 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-146 2e-39 ptr-mir-146a 3e-47 -38.7 .......((((((.(((((..((((((((((((.((((((((.((.......)))))))))).)))))))))))).)))))))))))............ (-38.70)