mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAGACTGAAGCTCCTTGAGG TCGAGGAGCTCACAGTCTAGTA TTTCCTGCCCTCGAGGAGCTCACAGTCTAGTATGTCTCATCCCCTACTAGACTGAAGCTCCTTGAGGACAGGGATGGTCATACTCACCTC 1 1 3' arm Macaca_mulatta mirbase mir-28 3e-35 mml-mir-151 4e-46 -46.2 .((((((.((((((((((((..((((((((((.(........).)))))))))).)))))))))))).)))))).(((.......))).. (-46.20)