mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTAGTTTCATGTTGTTGG GGCAACAAGAAACTGCCTGAG TGCTCGCTCAGCTGATCTGTGGCTTAGGTAGTTTCATGTTGTTGGGATTGAGTTTTGAACTCGGCAACAAGAAACTGCCTGAGTTACATCAGTCGGTTTTCGTCGAGGGC 1 0 5' arm Macaca_mulatta mirbase mir-196 2e-45 ggo-mir-196-2 6e-58 -51.2 ..(((((..(((((((.((((((((((((((((((.((((((((((.(..(...)..).)))))))))).))))))))))))))))))...)))))))...).))))... (-51.20)